希望と絶望のボーイミーツガール第２弾！

“臨界区域・東京”に戻ってきた蓮次たち。しかし、対立する救務庁の待ち伏せで叶方の命が危険に。更には“金色の糸”も出現する！　蓮次と叶方は“ハーメルン”を倒し、大切な人を取り戻せるか――!?

兩年之前，『東京』遭遇了災難——高中生秋月蓮次和著名偶像弓家葉方有著一個共同的秘密。他們是侵入了『臨界區域·東京』的『入侵者』，並使用AREA限定的特殊能力『SHOT』持續探索著。在與敵對的政府機關『救務廳』，還有AREA最可怕的怪物，人類之敵『EOM（EnemyofMankind）』三方混戰的情況下，他們能夠兌現彼此許下的『諾言』嗎！？

どれだけ傷ついても、どれだけ絶望に囚われても、戦うことを諦めない。

決死の“東京”侵入で、“スポット”と“ハーメルン”への手がかりを失った蓮次たち。活路を求める叶方は最後の手段――人気アイドルＫＡＮＡＴＡとして救務庁に潜入する。しかし、“奪還派”の起こしたクーデターに巻き込まれ!?　一方、別行動を取る蓮次にも救務庁の刺客が迫り、決死の逃亡劇が始まる。全世界を敵に回しても走り続ける蓮次。命をかけて希望を繋ぐ叶方。送る者と征く者――二人の魂と絆をかけた戦いが始まる!!