桐人進入謎一般的奇幻世界已經過了兩年。
他和好友尤吉歐成為「北聖托利亞帝立修劍學院」的「上級修劍士」後，隨即以當上人界最強秩序維持者「整合騎士」為目標，過著勤奮修行的日子。
這時身為「上級修劍士」的兩人也有了自己專屬的隨侍。桐人的隨侍名為羅妮耶，而尤吉歐的隨侍名為緹潔。正當四個人建立了良好關系，度過充實的修劍士生活時——
「惡意」突然朝他們襲來。
羅妮耶與緹潔落入了卑劣貴族們的陷阱中。得知她們陷入危機的尤吉歐雖然准備向惡人們拔劍，但對教會的信仰之心卻讓他無法動彈。這個時候，一道劇烈的疼痛感貫穿了尤吉歐的右眼，接著更浮現奇妙的符號。
那是一串尤吉歐無法閱讀的神聖文字列。
——「SYSTEM ALERT」。
神聖術師團長賽爾卡和整合騎士蘿涅與緹卓。在跨越了兩百年的時光後，桐人實現了與有緣人們的再會。然而—— 「……不是吧……還活著嗎……？」 有著和《他》相似容貌的男子——整合機士團長艾歐萊茵·赫倫茨的存在，在她們的心中引發了不可忽視的波紋。 還沒等這一衝擊冷卻下來，《敵人》的身影已然出現。愛麗絲等整合騎士與艾歐萊茵等整合機士——Under World的新舊兩代守護者，打響了戰鬥的第一槍。 另一邊，《Unital Ring》的攻略也進入了下一個階段。到達第二層的桐人團隊，又一次投身於新的戰鬥之中！
跟桐人有所牽扯的「死槍」事件結束後，又過了幾個禮拜。
在充滿了精靈角色的次世代飛行系VRMMO「ALfheim Online」裡，出現奇妙的騷動。
新地圖「浮游城艾恩葛朗特」第24層主要街道的北部，出現一名神秘人物。
這人以自己的「原創劍技」作為賭注與其他玩家進行一對一單挑，並且擊敗了所有對手。
這名人稱「絕劍」的劍術高手，甚至打敗了「黑色劍士」桐人。
亞絲娜雖然也向「絕劍」挑戰，但最後還是以些微差距敗在對方手下。
可是決斗一結束，「絕劍」竟然立刻邀請亞絲娜加入自己的公會!?
而在足以號稱「絕劍」的優異劍技之下，其實還隱藏著某件秘密——
由整合騎士貝爾庫利所率領的五千名人界守備軍，對上了由暗神貝庫達，也就是加百列·米勒所率領的五萬名侵略軍。
以「天穿劍」法那提歐為首的整合騎士，雖然為了扳回數量上的劣勢而不斷奮斗，但敵軍——山地哥布林族卻利用奸計穿越防衛線，突擊後方的補給部隊。少女練士羅妮耶與緹潔由於在後方保護心神喪失狀態的桐人，也因此而面臨了危機。
再加上侵略軍當中最為詭計多端的暗黑術師公會總長蒂伊·艾·耶爾也企圖以恐怖的大規模術式來殲滅守備軍……而登入Underworld的亞絲娜又身處何處呢——！
人界人的老人椏贊遭到山地哥布爾歐羅伊殺害。受到「禁忌目錄」與「力量鐵則」束縛的地底世界居民原本不可能引起這種事件，卻還是發生了。這是「幕後黑手」為了造成人界與暗黑界再次發生戰爭所使出的謀略。探尋真相的桐人雖然得到暗黑軍總司令伊斯卡恩的幫助，但還是在最後一刻被應該是犯人的「黑色斗篷男」逃走了。
在調查陷入膠著狀態時，亞絲娜試著在命案現場的旅館裡詠唱起「窺探過去術」。結果浮現出令人意外的影像……
這時候「幕後黑手」的毒牙也朝著整合騎士見習生羅妮耶與緹潔迫近——！
〈Moon cradle〉篇正式完結！
在充滿謎團的新世界『Unital Ring Ⅱ』的冒險，第二幕開演! 桐人、亞絲娜、愛麗絲被強制轉移到神秘的VRMMO遊戲『Unital Ring』之時。詩乃也被轉移到同一個世界。 「真是的……我竟然會被逼到這樣的絕境……」 在無數次的失誤之後，沒有同伴也沒有裝備，就連『TP值』都所剩無幾的情況下，詩乃為了生存而向Boss怪物宣戰。 另一方面，桐人等人也為守護森之家和搜尋詩乃而兵分兩路。 然而，前方，不僅有嚴酷的自然現象和強大的怪物，還有沖向木屋的襲擊者的身影——
在主角·桐人所登入，完全攻略前無法脫離的死亡戰斗MMO「Sword Art Online刀劍神域」中，除了有像他這種以抵達最上層為目標的「攻略組」，還有許多職業、想法各不相同的玩家存在。她們在無法登出游戲的嚴苛狀況下，仍充滿朝氣地生活著，歡笑並且哭泣，她們只是如此享受著「游戲」。「馴獸師」西莉卡、「冶煉商店」的女老板·莉茲貝特、謎樣小女孩·結衣，以及讓黑色劍士忘不了的少女·幸——獨行玩家·桐人與她們共同交織出的四個章節，即將在此開啟。
「盛開吧，藍薔薇！」
桐人與尤吉歐在象征「公理教會」的白色大理石塔「中央聖堂」裡，朝著最高司祭「亞多米尼史特蕾達」等待著他們的最上層前進。
途中兩人終於和「金木樨」的整合騎士愛麗絲再次見面了。但是桐人和愛麗絲的「武裝完全支配術」卻失去控制而破壞了高塔的外牆，兩人也因此被吸到聖堂外面。
與桐人分開的尤吉歐相信伙伴一定能存活下來，於是便獨自繼續朝塔頂前進。這時候最古老且最強的整合騎士——貝爾庫利·辛賽西斯·汪終於出現在他面前。
面對這名從小就相當憧憬的傳說武士，尤吉歐還是毅然拔出了藍薔薇之劍。
而這場決斗就在一名劍士的誕生下落幕了。
在桐人不在身邊的情況下，尤吉歐穿著整合騎士的鎧甲，眼神露出冰冷的光芒——
桐人為了調查槍與鋼鐵的VRMMO「Gun Gale Online」裡所發生的「死槍」事件而登入「GGO」。
桐人轉移過來之後，雖然遇上了乍看之下很容易被誤認是美少女角色的麻煩，但在經過狙擊手少女詩乃的引導之後，順利參加了決定最強槍手的對玩家淘汰賽「BoB」。
桐人在這個被槍支配的世界裡，成為唯一使用光劍戰斗並不斷在「BoB」裡獲勝的角色。而那種奇異的戰斗型態立刻造成了話題，他的知名度也跟著不斷上升。
時間終於來到了隔天的「BoB」正式大賽。在聚集了許多強敵的「多人數大混戰」當中，「死槍」終於現出身影。「死槍」他究竟是什麼人呢？「假想世界」真的能對「真實世界」產生影響嗎……桐人即將獨自挑戰「死槍」！
「幽靈子彈」篇，完結！
桐人從禁忌的死亡戰斗MMO「Sword Art Online刀劍神域」回到現實世界後，立刻前去尋找游戲時的伙伴，同時也是心儀對象的亞絲娜。
但是結城明日奈（亞絲娜）卻還沒從那個惡夢般的游戲裡歸還。
桐人也因此而陷入困惑與絕望當中。他唯一的線索是亞絲娜以「妖精」模樣佇立在鳥籠裡的奇異圖像文件。亞絲娜似乎是被困在一款高性能的VRMMO游戲「ALfheim Online」裡面。
桐人為了解救亞絲娜，一頭闖入這個有著無數妖精飛翔交錯的「ALO」世界……!!
在網絡上獲得超人氣的「妖精之舞」篇，正式展開!!
在象征「公理教會」的白色大理石高塔「中央聖堂」，透過被隔離在大圖書館裡的賢者「卡迪娜爾」的幫助，為了讓變成整合騎士的愛麗絲恢復成「真正模樣」的尤吉歐，以及為了避免這個地底世界被消滅的桐人一起朝著最高司祭「亞多米尼史特蕾達」等待著他們的最高層——第一百層前進。
終於來到了第九十九層時……
出現在桐人與愛麗絲面前的，是身穿整合騎士鎧甲，眼神顯露出冰冷光芒的尤吉歐。
面對毫不猶豫就拔劍相向的尤吉歐，桐人不得不展開迎擊。踏上旅途當天，從遠方雷鳴所感覺到的戰斗與別離的預兆難道要成真了嗎？記憶被封鎖的尤吉歐，真的能夠聽見桐人拼了命的呼喚嗎？
Alicization「人界篇」，完結！
桐人vs謎團重重的《槍手》伊斯塔爾。愛麗絲vs皇帝阿格馬爾。當在宇宙軍基地和中央大教堂上展開的戰鬥逐漸激化之時，《Under World》過去的守護者們終於覺醒了。 整合騎士第二位，法娜提歐·Synthesis·Two。以及《古代七騎士》的其中一人。其名為—— 另一側，現實世界中的明日奈，也與意想不到的人再次見面。 「……對不起，亞絲娜。這兩年裡一直沒有和你聯繫。」 相逢與重逢交織的《Unital Ring》篇，第七章！
「——是桐人。我的桐人回來了……」
地底世界「最終負荷實驗」第二天。
打敗「人界軍」最強整合騎士貝爾庫利以及使用超級帳號——太陽神索魯斯的詩乃後，加百列便追趕逃走的愛麗絲。
另一方面，被具壓倒性人數的「暗黑騎士」所包圍的「人界軍」誘餌部隊，
亞絲娜在戰場上的奮斗、莉茲貝特與西莉卡的助力全都落空，心神喪失狀態的桐人終於被微笑棺木的殘黨「PoH」抓住了。為了一吐長年的怨氣，PoH的毒牙朝著桐人迫近——
瞬間。
桐人的內心響起了聲音。那是和他一起生活、戰斗、歡笑的好友傳出的聲音。也是獨一無二的最佳拍檔的聲音——
這時候，為了拯救所有存活在Underworld的「一切」。
桐人終於復活了。
——「光之巫女」愛麗絲。即使犧牲所有黑暗軍隊也要得到她。
「最終負荷實驗」第二天。在整合騎士賭上性命奮戰之下屈居劣勢的黑暗領域軍，開始以卑劣的手段來反抗。從外部觀測Underworld的美軍傭兵——克裡達把現實世界的人類投入這場最終決戰當中。總共有超過五萬名的玩家，參加了所謂「正宗VRMMO游戲的封測」。
人界軍因為黑暗軍隊的增援而陷入瀕死的絕境。光靠亞絲娜一個人實在無法對抗如此龐大的軍隊。這個時候，地底世界傳說中的創世神們降臨了。她們是發出閃亮光芒的太陽神索魯斯，以及溫柔、溫暖的地母神提拉利亞。這兩尊神明，有著詩乃與莉法的外表……
無法完全攻略就無法離開游戲，GAME OVER也等於宣告玩家的「死亡」——大約一萬名毫不知曉謎樣次世代在線游戲「Sword Art Online刀劍神域（SAO）」「真相」為何的玩家登入後，這場死亡戰斗也隨之揭開了序幕。
身為其中一名SAO的游戲玩家——主角·桐人，比任何人都還早接受這款在線游戲的「真相」，他在游戲的舞台——巨大浮游城堡「艾恩葛朗特」裡，以不與人組隊的獨行劍士身分，逐漸嶄露頭角。
桐人原本以完全攻略的條件——到達城堡最上層為目標，持續單獨地進行嚴酷且漫長的冒險。但在刺擊劍高手·女劍士亞絲娜的強迫邀約之下，最後決定與她一起組隊。兩人的相遇也為桐人帶來了命中注定的契機——
在個人網站上連載時，創下超過650萬閱覽人數的紀錄！傳說中的小說即將登場！
《The Day Before》——《SAO》攻略期間，桐人向亞絲娜求婚，兩人過上了新婚生活。但到達新房的兩人看到的，卻是難以想象的場面……？ 《The Day After》——自從在新生《ALO》內以新的虛擬形象開始遊戲以來，亞絲娜經常遭遇神秘的《脫離現象》。這一現象的原因，是《SAO》時代的一起悲劇—— 《虹之橋》——桐人等人結束了海底神殿的冒險。然而海王利維坦和深淵之王克拉肯謎團重重的對話，將一行人引向新的冒險！ 《Sisters' Prayer》——《SAO》事件期間，某位少女接受了醫療用完全潛行機器《Medicuboid》的實驗。這就是《絕劍》優紀誕生的軌跡。
「桐人大人……亞絲娜大人……愛麗絲大人……歡迎回來。」 中央大教堂第八十層《雲上庭園》。在那裡等待著桐人一行的，是與思念之人的再會。 為了讓她們蘇醒，也為了探明逼近《Under World》的惡意的真面目，桐人飛向了被陰謀籠罩的行星阿德米娜。 與此同時，在《Unital Ring》世界中，詩濃和西莉卡等人，挑起了對區域BOSS的攻略戰。在缺少了身為主要戰力的桐人、亞絲娜和愛麗絲的情況下，勇猛善戰的眾人與BOSS的戰鬥越發白熱化——
桐人進入了一個神秘的奇幻世界，並且在那個帶有VRMMO感覺的空間裡，遇見一名感情豐富的少年。
不僅如此，他甚至跟這名看起來完全不像「NPC」的少年．尤吉歐結伴同行，前往央都「聖托利亞」。
兩年過去了──桐人和尤吉歐成為「北聖托利亞帝立修劍學院」的「初等練士」，各自接受前輩索爾緹莉娜以及哥爾哥羅索的指導，朝著成為人界最強秩序執行者「整合騎士」的目標前進。為了到達統率央都的「公理教會」中樞，他們倆排除萬難，立志要成為學院裡僅有的十二名「上級修劍士」──！
壯大的虛擬世界物語再度展開！
尤吉歐終於再次和從他一直在追尋的少女，愛麗絲見面。
但是愛麗絲早已沒有任何幼年時的記憶，而且還自稱是「整合騎士」。
在識破桐人為「外部」人類的神秘少女，卡迪娜爾的幫助下，
兩個人為了把愛麗絲恢復成「原本的模樣」而朝著塔頂前進！
與總務省虛擬課職員，菊岡誠二郎的再會。那是請桐人、亞絲娜和愛麗絲去《大戰》之後二百年的《Under World》的邀請。 等待著再次降臨那個世界的他們的，是羅妮耶和緹潔的後代羅蘭涅和絲緹卡，以及。「這就是自稱《星王》的男人的心意嗎。 ——請多關照，桐人君」 自稱《整合機士團》團長的那個男人，擁有與過去桐人失去的《他》同樣的眼睛——。 另一方面，《Unital Ring》世界中，瞄準桐人和夥伴們的最大的《惡意》終於現身!!
「SAO」事件後經過了一年。
某一天，桐人接到了總務省「假想課」菊岡誠二郎的奇怪委托。
那是在槍械與鋼鐵的VRMMO「Gun Gale Online」裡突然發生的「死槍」事件。
被拿著漆黑之槍的謎之角色所擊中的玩家，在現實世界裡也會隨之「死亡」……
無法拒絕幫忙調查的桐人，雖然對於「假想世界」對「現實世界」發生物理影響這件事感到不可置信，
但他還是登入了「GGO」。桐人為了尋找關於「死槍」的線索而在不熟悉的游戲裡徘徊。
這時對他伸出援手的，是一名慣用大型來復槍「黑卡蒂Ⅱ」的少女詩乃！
新章節突入！
與擁有和亡友同樣的眼睛、同樣的聲音的面具男子艾奧萊茵的邂逅，給桐人帶來了深深的沖擊。但是兩個虛擬世界中同時發生的異變，不允許他沈溺於感傷。 「說不定，這是新的異界戰爭的開始。」 兩百年後的《Under World》中，再次降臨的動亂的預兆。 另一方面，《Unital Ring》中，與《虛擬研究會》的穆塔希娜的決戰即將來臨。她率領的，是被可怕的窒息魔法《不祥者的絞輪》束縛著的，多達百人的大部隊。迎擊的桐人等人，構思了一個克服壓倒性劣勢的策略。
為了拯救尚未從SAO裡歸還的亞絲娜，桐人登入到可疑的VRMMO「ALfheim Online」裡。
這款次世代飛行系游戲「ALO」裡有著「魔法」概念，以及以玩家的反應力與判斷力來決定勝負的動作游戲要素，再加上能變成「妖精」在天空翱翔的「飛行系統」和不下於「SAO」的高性能，所以讓許多玩家深深為之著迷。在游戲當中成為「守衛精靈」的桐人，拼命朝著亞絲娜被幽禁的所在地——同時也是所有玩家最終目標的「世界樹」前進……！
在路途當中，桐人雖然因為「火之精靈」這個精靈種族的陰謀而陷入了九死一生的危機，但在得到「風之精靈」的少女‧莉法幫助以及導航妖精‧結衣的輔助之後，終於得以逃出生天。
而桐人最後終於來到「世界樹」的根部。但就在這個時候，莉法和桐人無意間知道了彼此的「秘密」……
「桐人，告訴我……我到底……該怎麼辦才好？」
打倒最高司祭亞多米尼史特蕾達的代價，是尤吉歐的死亡與桐人的心神喪失。
激斗的半年後。
愛麗絲帶著沒有意志，只以空虛表情坐在輪椅上的桐人委身在「盧利特村」。
把整合騎士「守護人界」的職責托付給貝爾庫利的愛麗絲選擇跟桐人一起度過安靜的生活。而賢者卡迪娜爾預言的「最終負荷實驗」也一刻一刻地逼近「地底世界」……
來自「黑暗領域」的邪惡氣息開始流入「人界」。恐怖的黑暗軍隊終於開始有所行動。
桐人與亞絲娜從「Underworld」回來之後已經過了一個月。兩人身邊還可以看見在現實世界獲得實體的愛麗絲身影。但是這樣的平穩突然就被破壞。
「…………等級1…………」
「我也變成等級1了！」
三個人突然被卷入謎樣的游戲「Unital ring」當中。
這是一款由「The seed」程序所建構，融合了所有VRMMO的「生存MMO」。
桐人在游戲一開始便失去所有愛用的裝備，身上只剩下一條內褲。
在九死一生的殘酷狀況之下，桐人將挑戰充滿謎團的「VRMMOSVG」——！
「這……這裡是什麼地方……？」
桐人一醒過來，馬上發現自己掉進了到處都是參天巨樹的森林──奇幻的「假想世界」當中。為了尋求線索而在附近亂逛的他遇見了一名少年。「我的名字叫尤吉歐。請多指教，桐人。」
這名假想世界裡的居民──也就是「NPC」的少年竟然擁有足以媲美人類的豐富感情表現。隨著與尤吉歐的友情越來越深厚，桐人腦袋裡也出現了過去的某段回憶。
桐人的回憶裡，還是小孩子的自己曾經和尤吉歐在深山裡到處亂逛。而且除了尤吉歐之外，還有另一名有著金黃色頭發的少女。少女的名字是愛麗絲。那是一個絕對不能忘記的重要姓名。
網絡上獲得最多支持的超人氣篇章登場！
「圈內事件」──「SAO」的中層地區發生了慘案，一名玩家遭到殺害。 然而，遇害現場卻是HP絕對不會減少的「安全圈內」。 就算假設這是一起PK事件，依然找不出凶手究竟是用什麼方法殺人， 於是桐人與亞絲娜開始追查起這宗懸案。
「斷鋼神劍」──「ALO」裡傳說的聖劍。入手這把劍的任務終於開始。 因守護聖劍的怪物實在太過棘手，桐人曾一度放棄取得這把劍； 趁著這次機會，他再度加入了爭奪的行列者當中。 只不過，這次的任務背後其實有某個非常壯大的活動。
「起始之日」──「SAO」正式上線的首日。在茅場晶彥宣布死亡游戲正式開始後， 桐人為了在游戲裡頭存活下去，定下第一個目標。 那就是先完成在封測時期曾有過攻略經驗的任務，取得比初期裝備更為強力的劍。
地底世界在歷經長達三百年的戰亂後終於統一了。
不知從何處出現的一名「貝庫達的肉票」打倒暗神，為這個世界帶來了和平。
但是，之後人界的中樞，白色巨塔「中央聖堂」裡──
晉升「整合騎士見習生」的羅妮耶·阿拉貝魯，從人界意志最高決定者「代表劍士」桐人那裡聽見了沖擊性的發言。
「──終有一天，會再次發生戰爭。」
描述「Alicization篇」在「地底世界大戰」之後發生的故事！
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桐人進入謎一般的奇幻世界已經過了兩年。
他和好友尤吉歐成為「北聖托利亞帝立修劍學院」的「上級修劍士」後，隨即以當上人界最強秩序維持者「整合騎士」為目標，過著勤奮修行的日子。
這時身為「上級修劍士」的兩人也有了自己專屬的隨侍。桐人的隨侍名為羅妮耶，而尤吉歐的隨侍名為緹潔。正當四個人建立了良好關系，度過充實的修劍士生活時——
「惡意」突然朝他們襲來。
羅妮耶與緹潔落入了卑劣貴族們的陷阱中。得知她們陷入危機的尤吉歐雖然准備向惡人們拔劍，但對教會的信仰之心卻讓他無法動彈。這個時候，一道劇烈的疼痛感貫穿了尤吉歐的右眼，接著更浮現奇妙的符號。
那是一串尤吉歐無法閱讀的神聖文字列。
——「SYSTEM ALERT」。