突然出現在人類面前的神秘飛翔體「災」。意味著災厄的此一存在憑藉異樣的戰鬥力凌駕於所有的航空戰力之上。 為對抗他們而開發的，便是對現有機體進行特別調整以實現超水準高機動力，被稱為「子體（DAUGHTER）」的兵器。負責操控的則是名為「阿尼瑪（ANIMA，意為靈魂）」的操縱機構。而它──竟擁有少女的外表。 因「災」的緣故而失去駕駛員母親的少年「鳴谷慧」，他遇見了閃耀鮮紅光輝的瑞典制戰鬥機以及駕駛它的阿尼瑪「格里芬（GRIFFIN）」。 身為人類最終兵器卻動作不穩定的格里芬，還有一心嚮往天空的少年，兩人漫長且炙熱的故事就此展開。
這次的阿尼瑪是俄國少女！ 因變態機動力在部分愛好者心目中擁有高人氣的 Su-47， 貝兒庫特終於登場了！ 流亡到日本的貝兒庫特失去記憶，處於不知為何而飛行的狀態。 但她的個性堅毅、坦率而且十分勤勞，在基地內成為注目的焦點。 面對表現得像個大姐姐的格里芬也漸漸變得親近起來。 另一方面，「災」的來襲在此同時也更為猛烈。 甚至出現了未知的新型戰鬥機， 戰局演變為前所未有的大規模空戰！
令人期待已久的艦載機阿尼瑪首次登場！ 隸屬於美軍，個性開朗直爽卻帶有神秘色彩的超級大黃蜂阿尼瑪「萊諾」出現在格里芬等人的面前！ 在她加入之後，針對「災」的反攻作戰也隨之發動！ 眾人從在東海上的航空母艦傑拉德．R．福特號起飛， 目標是奪回通往大陸的立足點，上海！ 「那麼，我先出發了。」法多姆今天也語氣冷酷地起飛。 「來比賽擊落數喔！」天真爛漫的伊格兒同樣也士氣高昂。 「慧，我們出發吧。」格里芬則是與慧攜手飛向藍天上的戰場！ 美少女 × 戰鬥機的故事，第三彈登場！
慧透過在非物質層次親眼目睹的事情，得知災的真面目和格里芬不合理的命運。 為了解放她，慧拒絕繼續作戰以及拯救世界。 在那樣的情況下，正在進行新子體運用試驗的英國本貝丘拉基地， 忽然遭到災的戰略兵器消滅。而災的下一個攻擊目標會是──小松？ 負責防禦的獨飛成員們，因為慧和格里芬不在而被迫陷入苦戰。 究竟慧會做出何種選擇──？ 另外，卷末還收錄描述那霸基地的守護神：Viper Zero 的活躍故事小短篇。 美少女 × 戰鬥機的故事，對抗格里芬命運的第八集！
擁有壓倒性戰鬥力的神秘飛翔體：災， 與擁有美少女兵器：阿尼瑪的人類之間的戰爭， 因在格里芬體內沉睡的「記憶」得到闡明，即將迎來新的局面。 可是，在下一個作戰地點越南等待著慧和格里芬的， 卻是過去曾經上演殊死戰的俄國阿尼瑪：Su-27 裘拉薇麗克等人。 雖然計劃的目標是共同完成作戰， 然而糾葛不清的雙方陣營卻瀰漫著一觸即發的緊張氣氛。 日俄阿尼瑪真有可能化敵為友、同舟共濟，順利達成任務嗎？ 邁向世界規模的戰爭，美少女 × 戰鬥機的故事第九集！
法國機終於登場！ 戴高樂號航空母艦連同護衛艦隊一併消失在南海上。 其裝載的貨物竟是閃耀瑪瑙黑光輝的子體孩──拉菲爾！ 慧與格里芬被賦予的任務，是從航母上回收拉菲爾。 在隸屬於法國軍方，黑色頭髮且一身褲裝打扮的布朗傑中尉陪同之下，他們穿過了「災」的大軍後抵達航母，在那裡等待的卻是一名小女孩── 此外，還有充斥著可愛小法多姆的新系統發動＆伊格兒來襲慧的家中並與明華之間一觸即發等事件。 戰鬥機╳美少女的故事，第五彈出爐！
夥伴遭到擊落，螢橋三等空尉被調離 F-15J。 陷入失意的時候，技本室長知寄蒔繪前來挖角他。 螢橋半信半疑地造訪技本， 在那裡等著他的是雙人座軍機 JAS39 獅鷲戰鬥機， 以及說著葡萄牙語，披著一頭淺桃紅色頭髮的阿尼瑪少女。 包含搭檔的少女格里芬在內，獲得全新羽翼的螢橋對「災」的敵意， 變得比以前更強烈。然而── 世界各地的阿尼瑪大舉集結，與「災」展開全面空戰？ 格里芬賭上自己的性命，跨越次元的另一個故事。
在蒙古礦山中，意外發現一千多年前的 F-15J 機翼殘骸。 為了在面臨「災」緊迫威脅的蒙古進行更深入的調查， 格里芬一行人接到回收其他零件的指令。 抵達當地後，一行人興致勃勃地想先享受在地美食， 卻有三名阿尼瑪少女出現在眼前。 閃耀著暖橘色光芒的隊長 Su-27 裘拉薇麗克、 海水藍外觀並散發冷酷氣質的 MiG-29 拉絲特裘卡， 以及法式米色且總是面帶笑容，機體不明的蒂．歐。 目標果然是 F-15J 殘骸的她們，與格里芬等人在蒙古上空展開激戰！ 系列故事峰迴路轉！日俄激烈交鋒的第六彈！
駕駛鮮紅色戰鬥機的美少女「格里芬」。 身為嚮往天空的少年「慧」的搭檔， 意志堅定的她卻處處不諳世事，其古怪的言行依舊令人不安。 駕駛棣棠色戰鬥機的金髮美少女「伊格兒」則天真爛漫、過度自信。 其心態是隻要開開心心擊敗敵人即可。 在這兩人的面前，如今又出現了新的戰鬥機美少女「法多姆」。 外表清純可愛的她，事實上卻是個表裡完全不一的棘手人物……？ 個性及想法迥異的三機編隊，即將出動迎擊神秘的敵性體「災」！ 戰鬥機 × 美少女的故事，第二彈登場！
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突然出現在人類面前的神秘飛翔體「災」。意味著災厄的此一存在憑藉異樣的戰鬥力凌駕於所有的航空戰力之上。 為對抗他們而開發的，便是對現有機體進行特別調整以實現超水準高機動力，被稱為「子體（DAUGHTER）」的兵器。負責操控的則是名為「阿尼瑪（ANIMA，意為靈魂）」的操縱機構。而它──竟擁有少女的外表。 因「災」的緣故而失去駕駛員母親的少年「鳴谷慧」，他遇見了閃耀鮮紅光輝的瑞典制戰鬥機以及駕駛它的阿尼瑪「格里芬（GRIFFIN）」。 身為人類最終兵器卻動作不穩定的格里芬，還有一心嚮往天空的少年，兩人漫長且炙熱的故事就此展開。