在真正的敵人艾伯特的籌畫下，數不清的幻想生物從大樹誕生墜下。
面對這些侵蝕世界的存在，除有京花、耶麗絲、雷雷等人相助之外，
曾經為敵彼此交手過的涅克薩爾、禰鈴，甚至奇里榭也都為了守護SIREN攜手抵抗。
另一方面，感應到大樹的胎動，沉眠於飛兒體內的真天使菲歐拉米莉絲開始覺醒，
打算犧牲自身封印大樹──
「你明白了嗎，米索拉？所以說……這就是宿命。」
為了阻止真天使那悲壯的決心，潛藏於米索拉體內的「方程式」現在就要釋放真正的力量及作用。
體內存在著天使的少女與癒合世界的少年，兩人的故事步入佳境！
為了得到體內存在著真天使的少女──飛兒，福音機關的特務「銀之第一相」迪魯聶海特以及「紅之第二相」禰鈴於SIREN現身。理裝執行者接連敗在他們手下。另一方面，曾經為敵的「藍之第三相」涅克薩爾也來到米索拉的面前，從他口中卻聽到始料未及的內容──「我只要妹妹回到我身邊，除此之外別無所求。」其妹．禰鈴的內心遭機關給予的強大力量支配著，涅克薩爾全是為了救出她而戰，米索拉獲知他的想法便挺身與紅之第二相．禰鈴一戰。米索拉的方程式與涅克薩爾的新約召喚產生共鳴時，能夠打破禁錮的詛咒嗎？
SIREN第三衛星都市的特別警報鳴聲大作。打敗了好幾名理裝執行者的最強Ω指定種生化物──
代碼名「紅色標記」入侵，都市壟罩在恐懼之下。連中央統合樹都放棄追捕的史上最凶惡流浪個體。
其真實身分是極為特殊、絕不容許人類侵犯的「傳說中的龍人」。
「人類……你們到底要觸犯我的逆鱗多少次才甘願！」僅僅只因生化物與人類之間些許的誤解，
「她」失控了。 在其壓倒性的殘酷行徑下，米索拉重要的友人也一個接一個被打傷。
為了朋友、以及孤獨的「她」，米索拉挺身面對看不見勝算的戰鬥──
當人類的科學與神的幻想交錯時，天使的歌詠便隨之響起！
次世代（Biotesta）新生物——乃是再現龍或妖精等虛構物種的生命工學結晶。其最先端研究領域「SIREN」的學生米索拉遇見了一名彷徨街頭，實為天使型生化物的少女飛兒。她正在找尋創造者母親，而創造者的名字「安娜斯塔西亞」對米索拉來說，卻是再熟悉不過——
生化物飛兒是天才生命科學家安娜斯塔西亞創造出來的「天使調和體」。
「SIREN」的學生米索拉承其師志，決定守護飛兒。
然而這也意味他選擇與科學世界以及幻想世界雙方為敵。
某日，米索拉得知失控生化物「暴君」的運送計畫。
對科學世界以及幻想世界而言，「幻獸的不完全融合體」暴君是個無論如何都得封鎖住的存在。
米索拉則決意解放命運遭到世界任意玩弄的暴君。
這是因為暴君跟飛兒一樣，都是需要保護、拯救的存在──米索拉的「方程式」現在就要啟動！
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在真正的敵人艾伯特的籌畫下，數不清的幻想生物從大樹誕生墜下。
面對這些侵蝕世界的存在，除有京花、耶麗絲、雷雷等人相助之外，
曾經為敵彼此交手過的涅克薩爾、禰鈴，甚至奇里榭也都為了守護SIREN攜手抵抗。
另一方面，感應到大樹的胎動，沉眠於飛兒體內的真天使菲歐拉米莉絲開始覺醒，
打算犧牲自身封印大樹──
「你明白了嗎，米索拉？所以說……這就是宿命。」
為了阻止真天使那悲壯的決心，潛藏於米索拉體內的「方程式」現在就要釋放真正的力量及作用。
體內存在著天使的少女與癒合世界的少年，兩人的故事步入佳境！